Depende de donde vayas a descargar. Si es un APK infectado con virus que has descargado de una web desconocida, definitivamente puede dañar el celular. Te recomiendo que descargues aplicaciones de Google Play solamente. O de repositorios confiables como F Droid o apkmirror. En cuanto a launchers o lanzadores se refiere, te recomiendo descargar Nova Launcher o Action Launcher.